高町奈叶（田村由香里 配音）是一位平凡的高中三年级学生某日在上学的路上她同来自异世界米德其路达的尤诺（水桥香织 配音）相遇了尤诺告诉奈叶她正在寻找遗落人间的太古遗产“圣石之种”这种珍贵的宝物蕴藏着巨大的能量如果弃之不顾有可能在人间界造成巨大的破坏接二连三的波折之后奈叶成为了帮助尤诺回收种子的魔法少女开始了一段充满了危险和刺激的奇幻旅程 　　某日一位名叫菲特（水树奈奈 配音）的金发少女出现在了奈叶的面前她和奈叶一样同为回收种子的魔法少女也就是说她们的关系是竞争者奈叶能够打败这样一位强劲的对手吗对于菲特来说温柔而又努力的奈叶又是一种怎样的存在呢