故事发生在战国时代普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者在父亲的劝说下他离开家乡摄津进入当时一流的忍者学园学习在学校他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子为人迷迷糊糊对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿为人精明贪财吝啬这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚当然以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 　　本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编改编成动画时因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉